Хочется задать структуру еще на берегу. Одно из решений — применение одного и того же шаблона для структуры папок и файлов.
Можно, например, использовать Cookiecutter. Это библиотека, которая позволяет настроить под себя стандартный шаблон, а потом при запуске нового проекта сразу его разворачивать. Есть уже готовый отличный шаблон для Data Science проектов, а вот пример шаблона для исследовательского проекта.
В базовом случае для работы хватит пары команд:
pip install cookiecutter
cookiecutter <ссылка на репозиторий с шаблоном>
Добавьте к этому правила именования файлов, и работа со старыми проектами существенно упростится.@evidencespace
