🧠 ИИ MERLIN восстанавливает местоположение иммунных клеток в почках и головном мозге

При секвенировании отдельных клеток (scRNA-seq) учёные получают детальный генетический профиль, но теряют важное — информацию о том, где именно клетка находилась в органе. Это как изучать город по мебели, не зная района.

Алгоритм MERLIN (Machine Learning-Enabled Regional Localization of Leukocytes), разработанный учёными из Боннского университета, решает эту проблему. Он анализирует паттерны экспрессии генов и предсказывает, из какой области почки или мозга происходит иммунная клетка — без анатомических карт и изображений.

Исследователи показали, что резидентные макрофаги сохраняют «молекулярную память» о своей среде. MERLIN определяет их локализацию с точностью до 80% у мышей и более 70% у человека. В мозге алгоритм также успешно реконструировал положение микроглии.

Особенно важно, что инструмент работает даже при воспалении и помогает выявлять региональные особенности заболеваний — от гломерулонефрита до диабетической нефропатии.

MERLIN открывает новое измерение в анализе уже существующих данных: молекулярную географию иммунной системы. Теперь клетки могут «рассказать», где они жили.

Результаты исследования опубликованы в журнале Advanced Science.

БиоТехнологии