📕JCTC и JCIM ужесточают требования к воспроизводимости
https://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/acs.jctc.6c00733
Вышел совместный editorial двух ведущих журналов по вычислительной химии — Journal of Chemical Theory and Computation и Journal of Chemical Information and Modeling.
Главное: с 1 мая 2026 года все оригинальные исследовательские статьи обязаны сопровождаться данными и кодом, необходимыми для воспроизведения ключевых результатов. Статьи должны содержать Data and Software Availability Statement.
Что конкретно просят шарить:
— скрипты и код для расчётов
— входные и выходные файлы
— координаты систем и параметры силовых полей
— ключевые численные данные (энергии, свободные энергии и т.д.)
— траектории МД и файлы рестарта
— AI/ML модели с описанием архитектуры, гиперпараметров и разбивки train/val/test
— поверхности потенциальной энергии
Репозитории — GitHub, Zenodo, Figshare или институциональные, с persistent identifiers (DOI).
Для новых теоретических методов — полное описание теории и алгоритма, включая ключевые выводы в SI.
Редакция оговаривается: не все пункты нужны каждой статье, а конфиденциальные компоненты не должны быть необходимы для воспроизведения основных выводов.
Post #44
500
Forwarded from Chem ML/AI/Datasets
ACS Publications Advancing Reproducibility and Open Data in Theoretical and Computational Chemistry We are pleased to present this joint editorial from the Journal of Chemical Theory and Computation (JCTC) and the Journal of Chemical Information and Model- 👍 8
- 🤔 2
- 🦄 1