وقتی یک ژنوم، متعلق به یک گونه نیست.

در سال ۲۰۲۰، مقاله‌ای در Scientific Data یک ژنوم مرجع ۲۴۰ مگابازی برای نماتد گره‌ریشه Meloidogyne enterolobii معرفی کرد. مقاله گزارش می‌کرد که آلودگی‌ها با ترکیبی از BlobTools، BLAST، درصد GC و عمق پوشش شناسایی و حذف شده‌اند.

اما بررسی مجدد نشان داد که فایل‌های توالی‌یابی، حاوی داده‌های دو گونه بوده‌اند و اسمبلی نهایی ترکیبی از:
M. enterolobii + M. incognita
بوده است. در نتیجه، اعتبارسنجی مجموعه‌داده قبلی نامعتبر اعلام و مقاله در ژانویه ۲۰۲۵ پس گرفته شد.

در پست بعدی بررسی می‌کنیم چگونه آلودگی یک گونه نزدیک می‌تواند از کنترل‌های رایج عبور کند و اعتبار کل یک ژنوم مرجع را زیر سؤال ببرد.
━━━━━━━━━━━━━━━━━
@Connectosome