Искусственное, как обычно, лучше естественного. На этот раз на примере CRISPR

Генные редакторы, созданные ИИ, могут быть мощнее природных CRISPR‑ферментов. Не улучшенные версии существующих Cas‑белков, а полностью новые, синтетические ферменты, которых в природе никогда не было. И главное - они работают не просто "как настоящие", а лучше настоящих, причём сразу в трёх системах: бактериях, человеческих клетках и растениях.

Исследователи взяли компактный фермент TnpB - древнего предка Cas12 - и с помощью модели ESM‑IF1 начали генерировать тысячи новых вариантов. Алгоритм предлагал полностью новые аминокислотные последовательности, а учёные вручную фиксировали только те участки, которые критичны для распознавания ДНК и РНК. Из 1 980 созданных вариантов 466 показали активность, а около 8% превзошли природный фермент в бактериальных тестах. В человеческих клетках два синтетических фермента достигли 46% и 50% эффективности редактирования, тогда как природный TnpB давал 28%. На отдельных участках ДНК лучшие варианты обеспечивали почти четырёхкратное увеличение эффективности.

Эти ферменты действительно новые. Их ключевые домены имеют только 83% и 72% сходства с природными аналогами - то есть ИИ создал рабочие молекулярные контакты, которых нет в природе. Это принципиально отличается от предыдущих моделей, которые генерировали почти идентичные белки с >99% сходства.

Если это направление продолжит развиваться, CRISPR‑инструментарий перестанет быть набором природных ферментов - и станет полноценной инженерной платформой, где редакторы создаются под задачу, а не под то, что дала эволюция