✏️معمای شکل و عملکرد
از توالی خطی تا ماشین‌های سه‌بعدی زیستی!🏗️

2️⃣قسمت دوم

🔍در پست قبل دیدیم که چطور توالی‌های اولیه را پیدا می‌کنیم.

🗡️حالا در گام دوم (T2)، باید ببینیم این توالی چطور تا می‌خورد. حتماً اسم AlphaFold2 به گوشتان خورده است. این ابزارها با استفاده از تاریخچه تکاملی (MSA)، ساختار پروتئین را با دقت شگفت‌انگیزی پیش‌بینی می‌کنند.

اما پروتئین‌ها در سلول تنها نیستند! ابزارهای جدیدتر مثل AlphaFold3 حتی می‌توانند برهم‌کنش پروتئین با DNA، RNA یا داروهای کوچک را هم شبیه‌سازی کنند (T2b)

⚙️گام سوم (T3) پیش‌بینی عملکرد است. حالا که شکل پروتئین را می‌دانیم، ابزارهایی مثل MaSIF جایگاه‌های اتصال (Binding sites) را پیدا می‌کنند و حتی پیش‌بینی می‌کنند که کدام بخش‌ها ممکن است دچار تغییرات پساترجمه‌ای (PTMs) مثل فسفریلاسیون شوند.

💡حالا که می‌تونیم ساختار و عملکرد پروتئین‌های موجود رو پیش‌بینی کنیم، چی می‌شه اگه بخوایم یه پروتئین "کاملاً جدید" که اصلاً تو طبیعت وجود نداره خلق کنیم؟

✔️لینک #مقاله

🧬در کانال آکادمی زیست اومیکس با ما همراه باشید…
| @BioOmics_Academy |