Что почитать у Артема Исаева? Мы собрали несколько публикаций, которые хорошо показывают основные направления работы Артема Исаева, героя нашего нового интервью, и его коллег — от молекулярных механизмов бактериального иммунитета до метагеномики и фаговой терапии.

🧬 Как BREX распознаёт чужую ДНК

Ученые определили структуру ключевого белка BREX BrxX в комплексе с ДНК и показали, как система распознаёт чужой генетический материал. Работа также помогает понять, как бактериальная защита может быть обманута фаговым белком Ocr.

✂️ Как бактериальная система PARIS разрезает тРНК

Система PARIS защищает бактерии от вирусов, запуская разрушение клеточных РНК. В этой работе подробно разобран механизм действия нуклеазы AriB и её специфичность к тРНК.

🛡 Как бактерии могут выключать CRISPR-Cas

Исследователи провели поиск anti-CRISPR-белков и обнаружили AcrIE9 — ингибитор CRISPR-Cas типа IE у E. coli K-12. Белок взаимодействует с компонентом Cascade и мешает комплексу связываться с ДНК. Важно: это препринт, который на момент публикации не прошёл рецензирование.

🧫 Новая система рестрикции-модификации у Bacillus

Авторы охарактеризовали новую систему BlihIA у Bacillus licheniformis, определили её сайт распознавания и показали, что белок ArdB способен подавлять её активность.

🧪 Как удешевить метагеномные исследования

Метагеномика начинается с довольно прозаической проблемы — выделения ДНК. Авторы сравнили восемь коммерческих наборов для разных типов образцов и показали, какие из более доступных вариантов могут конкурировать с референсными наборами.

🦠 Как фаг BF23 обходит бактериальную защиту

Бактерии защищаются от фагов, но и сами вирусы не остаются безоружными. В этой работе исследователи разобрали, как фаг BF23, близкий родственник T5, избегает бактериальных систем рестрикции и модификации.

🔬 Как рекомбинация плазмид нарушает защиту EcoKI

Исследователи показали, что появление определённых плазмид может запускать у бактерии механизм ослабления системы рестрикции EcoKI. Получается своеобразный конфликт между мобильными генетическими элементами и собственной защитой клетки.

🧬 Что скрывается внутри терапевтического фагового коктейля?

Из коммерческого фагового препарата исследователи выделили новый литический фаг Sxt1 — родственник T3 с более широким спектром хозяев. Работа показывает, почему даже хорошо знакомые терапевтические коктейли могут содержать ещё не изученные вирусы.

Больше о работе Артема Исаева, его лаборатории и о том, как исследуют защитные системы бактерий, — в нашем новом интервью.

Проект «Биология в России: люди и открытия» реализуется Биомолекулой при поддержке Министерства науки и высшего образования Российской Федерации в рамках инициативы «Десятилетие науки и технологий». Партнером проекта выступила компания BioinnLabs.

#Биомолекула_БиологияВРоссии