AlphaFold AlphaFold’у рознь! AlphaFold 3 (AF3) — это не просто обновлённая версия AlphaFold 2 (AF2). Изменился сам принцип его работы.

В AF2 структура белка собиралась через геометрические «рамки» аминокислот и специальные механизмы, которые помогали нейросети учитывать пространственную симметрию. AF3 от этого отказался: его диффузионная модель работает непосредственно с координатами и может уточнять структуру вплоть до отдельных атомов.

Заодно расширился и круг задач: если AF2 в первую очередь был инструментом для белков, то AF3 работает с целыми молекулярными комплексами — белками, ДНК, РНК, лигандами, ионами и модификациями.

Все ключевые различия мы собрали в таблице на картинке. По ней хорошо видно, насколько сильно AF3 отличается от своего предшественника — несмотря на то, что оба называются AlphaFold.

А если хотите подробнее разобраться в устройстве AlphaFold 3, добро пожаловать к нам на сайт!

#Биомолекула_инфографика