Соревнование по машинному обучению в геномике: EPIC
epic.autosome.org

Команда создателей IBIS запустила соревнование EPIC (Eukaryotic Promoter and transcription Initiation prediction Challenge).

Задача – по одной только последовательности ДНК предсказать, где и с какой силой РНК-полимераза II начинает транскрипцию (с точностью до нуклеотида и цепи). Модели предстоит работать с данными пяти немодельных организмов: тихоокеанской устрицы, калифорнийского осьминога, амбарной огневки, молочайного клопа и тихоокеанского катрана.

Что внутри:
• Уникальные неопубликованные данные csRNA-seq из лаборатории Саши Дуттке (Sascha Duttke).
• Разрешено использование и дообучение любых геномных моделей (AlphaGenome, Evo2 и др.)
• Команды от 1 до 10 человек, регистрация через GitHub
• Две метрики: факт инициации (AUPRC) и ее сила (Spearman)

Бонусы и соавторство:
• Все участники, обошедшие базовый бейзлайн, войдут в консорциум EPIC как коллективные соавторы итоговой статьи в рецензируемом журнале.
• Медалисты получат личное соавторство.

Для разминки уже доступен датасет по Nematostella и скрипты для локальной оценки.

🌑 Соревнование уже стартовало и продлится до 30 ноября 2026 года.

☁️ Подробности и регистрация
☁️ Технический чат в Telegram

Собирайте команду и подключайтесь к задаче!

✨ Мы в VK | Мы в почте | Мы в Telegram

#bioinf_online #bioinf_education
@bioinformatics_institute