💊
Machine Learning: Медицинский дайджест за период 7.09 - 14.09 2024 года🟩
BrainWave: модель для анализа сигналов головного мозга.BrainWave – модель, обученная на 40 000 часах инвазивных (iEEG) и неинвазивных (EEG) записей мозговой активности 16 тыс пациентов. Это первая фундаментальная модель для анализа сигналов мозга, объединяющая данные из разных источников.
🟩 DS-ViT: Visual Transformer для ранней диагностики болезни Альцгеймера.Dual-Stream Vision Transformer (DS-ViT) -метод, который объединяет сегментацию и классификацию для улучшения точности обучения моделей, обрабатывающих снимки МРТ головного мозга.
Он использует FastSurfer в качестве обучающей модели для детальной сегментации для обучаемой ViT-модели ADAPT (модель диагностики болезни Альцгеймера).
🟩 EyeCLIP: фундаментальная VLM для офтальмологических изображений.
EyeCLIP, визуально-языковая фундаментальная модель (VLM), обученная на более чем 2,77 миллионах мультимодальных офтальмологических изображений и 11 180 текстовых описаний от 128 000 пациентов.
Модель может выполнять задачи классификации заболеваний глаз, прогнозирование системных заболеваний, поиск информации по изображению и тексту и ответы на вопросы, связанные с изображениями патологии глаз.
🟩 Возможности SAM для сегментации опухолей мозга.
В исследовании изучается эффективность SAM для сегментации опухолей головного мозга на основе набора данных BraTS2019, который содержит изображения четырех модальностей (T1, T1ce, T2, FLAIR). Авторы оценивают эффективность SAM с использованием двух типов маркирования - точки и рамки и анализируют влияние количества маркирования на точность сегментации.
Результаты показывают, что SAM с маркировкой в виде рамок превосходит по точности маркировку в виде точек. Увеличение количества точек улучшает производительность до определенного предела, после которого точность начинает снижаться. Комбинирование точечных и рамочных маркировок позволяет добиться наилучших результатов.
🟩 MEDIC: Оценка языковых моделей для клинического применения.MEDIC использует пять ключевых измерений клинической компетентности: медицинское мышление, этические аспекты и предвзятость, понимание данных и языка, контекстное обучение и клиническая безопасность.
Оценка проводится тестированием на задачах: ответы на закрытые и открытые вопросы, суммирование медицинских текстов и создание клинических заметок. Для оценки безопасности моделей используется набор данных Med-Safety, содержащий 900 сценариев с потенциально опасными медицинскими запросами.
Приложения с использованием языковых моделей.
🟪 KARGEN: генерация отчетов рентгенографии грудной клетки с использованием графа знаний и больших языковых моделей.KARGEN - фреймворк, объединяющий большие языковые модели с графом знаний, специально разработанным для анализа рентгенограмм грудной клетки.
Архитектура KARGEN: энкодеры визуальных признаков (Swin Transformer), модуль слияния (element-wise fusion + modality-wise fusion) и генератор отчетов.
Энкодер визуальных признаков извлекает признаки из рентгеновского изображения, граф знаний, построенный на основе взаимосвязей между 14 заболеваниями из набора данных Chexpert, используется для извлечения признаков, связанных с этими заболеваниями.
🟪
i-MedRAG: итеративный поиск информации для ответов на сложные медицинские вопросы.i-MedRAG - архитектура RAG, предназначенная для ответов на сложные медицинские вопросы, требующие многоэтапных рассуждений. В отличие от традиционных RAG-систем, i-MedRAG использует итеративный подход к поиску информации.
Методики и техники
🟦 Автоматическая сегментация клеток с использованием UNet в DeepChem.В статье описан эксперимент создания интеграции модели UNet, архитектуры, известной своей эффективностью в задачах сегментации изображений, с python библиотекой DeepChem, предназначенной для машинного и глубокого обучения в биологии и химии, для задач автоматической сегментации клеток на различных наборах данных микроскопических изображений.
🔥
Полный дайджест @ai_machinelearning_big_data #news #ai #ml #medtech
