Специально для МРТ: библиотека Nilearn
Nilearn — легковесная Python-библиотека анализа данных МРТ. Она предоставляет статистические инструменты и средства машинного обучения, подробную документацию и открытое сообщество.
Nilearn теперь включает в себя функциональность библиотеки Nistats и расширяет ее новыми фичами. Она поддерживает анализ на основе общей линейной модели (GLM) и использует средства scikit-learn для многомерной статистики с такими приложениями, как прогнозное моделирование, классификация, декодирование или анализ связности. Nilearn отлично визуализирует результаты анализа в проекциях человеческого мозга.
Библиотека доступна под лицензией BSD и активно обновляется: версия 0.1.1 вышла в 2015 году, а на июнь 2022 года выпущен релиз 0.9.1. https://nilearn.github.io/stable/index.html