امیررضا بهرامنی

شروین صفوی از نوروساینتیست‌های خیلی خوب ایرانیه که چند سالیه آزمایشگاه خودش رو در آلمان راه انداخته. الان هم به دنبال جذب پست‌داک و دانشجوی دکترا هستن. اگر علایق و بکگراندتون میخوره حتما چک کنید.

• PhD (based at TU Dresden, Germany): https://nextcloud.tuebingen.mpg.de/index.php/s/wbpcYQ5pgMjDJos
• Postdoc (based at the Max Planck Institute for Biological Cybernetics, Germany): https://nextcloud.tuebingen.mpg.de/index.php/s/wjKjAHRidF5R4M8


We, the Natural Decision Making Group and the Embodied Decision Making Group, are joining forces within the CMC Unit to uncover the computational, biological, and ecological principles underlying adaptive decision-making. We combine computational methods from reinforcement learning, dynamical systems, and AI with analyses of neural and behavioral data to investigate how different species adapt their decisions to the dynamics of their natural environments, while accommodating their embodied constraints.
We would appreciate it if you could share these calls with anyone who might be interested in your network.

@bahramani_ch

همیشه عاشق این نوع کارهام که دقیق یه سیرکت رو مشخص می‌کنن :دی

درمورد «خواب»، به زبون ساده و آدمیزادی، همیشه اینطور میگفتن که بدنبال همزمانی فعالیت نورون‌های مهاری (و نه اینکه هر کردومشون جداگونه اکتیو/دی‌اکتیو شن) در سراسر مغز، سیستم خاموش می‌شه. منتها اینکه چطوری، کدوم نورونای مهاری، کجاها دقیییق خیلی مشخص نبود.


توی این کار که تو نیچر نیچر هم چاپ شده اومدن با مجموعه‌ای متدهای مختلف سیرکت رو درآوردن و قشنگ میگن کدوم ساب‌تایپ خاص توی مغز موش (که خیلی هم پترن sparseی داره ولی دست آکسوناش به تقریبا همه جا هم می‌رسه: Sst-Chodl cells) مسئول این خاموش کردن مغز هستن: یهو اگه با هم اکتیو بشن، اروزال پایین میاد و خواب‌تون می‌بره.

حالا باز البته کلی سوال دیگه هم اینجا بوجود میاد منتها بگذریم :))


https://www.nature.com/articles/s41586-026-10876-y?utm_source=x&utm_medium=social&utm_campaign=nature&linkId=63673403

@theNeurologue 🧠

اینجا همونجایی هستش که Moserها هستن

https://www.jobbnorge.no/en/available-jobs/job/307990/phd-in-computational-neuroscience

@bahramani_ch

خیلی پیشنهاد میشه
سخنران‌های خیلی خوبی براش انتخاب شدن و فکر کنم حسابی بحث بالا بگیره!😁

https://www.eventbrite.co.uk/e/student-symposium-what-can-neuroscience-teach-us-about-the-mind-tickets-1994644803301?aff=oddtdtcreator

@bahramani_ch

نخستین کنفرانس علوم اعصاب شناختی

پژوهشکده علوم شناختی پژوهشگاه دانش‌های بنیادی (IPM) برگزار می‌کند:

📍 نخستین کنفرانس علوم اعصاب شناختی
📅 ۱۲ و ۱۳ دی‌ماه ۱۴۰۵

📍 پژوهشگاه دانش‌های بنیادی، فرمانیه، تهران

ثبت‌نام و ارسال مقالات از پایان مهرماه ۱۴۰۵ آغاز خواهد شد.

به زودی اطلاعات تکمیلی، فراخوان مقالات و جزئیات ثبت‌نام اعلام می‌شود.

به تداوم راه علم 🧠

@CNC_IPM

پژوهشکده علوم شناختی پژوهشگاه دانش‌های بنیادی برگزار می‌کند:

سلسله سخنرانی‌های علوم اعصاب

Brain Mechanisms of Behavioral Strategies in Reward Seeking

یکشنبه
۲۲ شهریور ۱۴۰۵
شروع: ساعت ۱۵:۰۰

لینک جلسه:
https://skyroom.online/ch/ipm-scs/seminar

و
https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.30.747945v1

Maybe hippocampus is not as special as we thought!

https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.29.747979v1

@bahramani_ch

https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.19.745564v1.full

این مقاله ادامه کار قبلی همین گروهه که اینجا ارائش داده بودم:
https://www.youtube.com/watch?v=3Q1wipkS83M

مقاله‌های خیلی خوبین برای دیدن کاربرد روش‌های آنالیز جمعیت نورونی. خصوصا این آخری برای مقایسه همزمان دوتا ناحیه هم متودهای جالبی داره.

@bahramani_ch

دیتاست‌های با دسترسی آزاد (open) در نوروساینس امروز کاربرد خیلی زیادی دارن. یکی از مهمترین این دیتاست‌ها HCP هستش.
دکتر راجی‌مهر یکی از بهترین افرادی هستش که در ایران روی این دیتا کار میکنه و چند سالی هست که ورکشاپ کار با این دیتا رو برگزار میکنه.
امسال منم اولش یک تاک مجازی یکی دو ساعته درباره دیتاست‌های آزاد نوروفیزیولوژی دارم.

🟢 دوره تخصصی آشنایی با دیتاست‌های معتبر نوروساینس و ورکشاپ آشنایی با Human Connectome Project

▪️امروزه پژوهش در نوروساینس لزوماً به معنای تولید داده از نقطه صفر نیست.

▫️با توجه به هزینه‌های بالای تجهیزات و نمونه‌گیری در مطالعات نوروساینس، استفاده از دیتاست‌های معتبر مسیری نوین برای بازتحلیل و انجام مطالعات جدید است.

اما استفاده علمی از این منابع فراتر از یک دانلود ساده است. در این دوره به پرسش‌های زیر پاسخ می‌دهیم:

▪️ ماهیت و ساختار داده‌ها چیست؟

▪️ سازمان‌دهی و محدودیت‌های آن‌ها چگونه است؟

▪️ چه پرسش‌های پژوهشی با آن‌ها قابل بررسی است؟

سرفصل‌ها:

▫️ بخش اول: آشنایی با انواع دیتاست‌های معتبر (نوروایمیجینگ و نوروفیزیولوژی)، شیوه دسترسی، ساختار و ملاحظات پژوهشی.

▫️ بخش دوم: ورکشاپ عملی HCP

🗓️ ۳۱ شهریور الی ۲ مهر ۱۴۰۵ | ۲۰ ساعت
📌 حضوری | دانشگاه علوم پزشکی ایران
📃 ارائه گواهی انگلیسی با مهر رسمی دانشگاه

⚠️ نظر به ماهیت عملی دوره و همراهی مستقیم اساتید و TAها، ظرفیت این دوره به‌صورت هدفمند محدود است.

🔗 ثبت‌نام و کسب اطلاعات بیشتر:
اینجا کلیک کنید.

تلگرام | اینستاگرام | لینکدین | یوتیوب

به بهونه‌ی این مقاله اخیر* درباره‌ی BOLD و neurovascular coupling، بد نیست دوباره یادآوری کنیم که fMRI دقیقاً چه چیزی رو اندازه می‌گیره و مهم‌تر از اون، چه چیزی رو مستقیم اندازه نمی‌گیره.

این چهار مقاله زیر در کنار هم یه پیام مهم دارن: BOLD signal رو نباید به‌صورت مستقیم معادل neuronal firing یا حتی یک شاخص واحد از “brain activity” در نظر بگیریم.

چیزی که ما در fMRI می‌بینیم در واقع خروجی یک زنجیره‌ی پیچیده از neurovascular و metabolic پروسس‌ها هستن؛ blood flow، blood oxygenation، oxygen metabolism، glucose metabolism و حتی architecture خود عروق می‌تونن هر کدوم رفتار متفاوت و تا حدی مستقل از هم داشته باشن. مثلاً ممکنه BOLD پایین بیاد ولی glucose metabolism ثابت بمونه، یا حتی جهت تغییر BOLD با oxygen metabolism مخالف باشه؛ از اون طرف، یک مقدار مشابه از neuronal activity هم بسته به نوع input و شبکه‌ی عروقی اون ناحیه می‌تونه blood-flow response متفاوتی ایجاد کنه. بنابراین BOLD بیشتر از اینکه یک readout مستقیم از فعالیت نورون‌ها باشه، یه composite proxy از چندین process به‌هم‌وابسته‌ست که coupling بینشون نه در همه‌ی نواحی مغز یکسانه و نه همیشه ثابت؛ و احتمالاً بخشی از این physiological complexity رو هنوز هم کامل نمی‌شناسیم.


Dissociations between glucose metabolism and blood oxygenation in the human default mode network revealed by simultaneous PET-fMRI
https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2021913118

BOLD fMRI reflects both vascular and metabolic signals
https://www.nature.com/articles/s41593-026-02288-y

BOLD signal changes can oppose oxygen metabolism across the human cortex
https://www.nature.com/articles/s41593-025-02132-9

*Modality-specific neurovascular coupling via layer-segregated arteriole networks
https://www.science.org/doi/10.1126/science.aeb5077

@theNeurologue 🧠

توی SWC یک گروه خیلی جالبی هست به نام Neuroinformatics Unit (NIU) که هدفش توسعه ابزارهای open source برای نوروساینس هستش و پروژه‌های متعددی توی شاخه‌های مختلف نوروساینس داره.
یکی از پروژه‌هاشون که منم چند ماهیه پارت‌تایم توش دخیلم BrainGlobe هستش. هدفش ساختن یک API واحده برای کار کردن با داده‌های نوروآناتومی و طبیعتاً مهمترینش یعنی اطلس‌های مغز.
مثلاً یکی از کارهایی که انجام میدیم اینه که اطلس‌های مختلف گونه‌های مختلف که ساخته شده رو در قالب یک ساختار واحد package میکنیم. این باعث میشه که شما بتونید با یک API ثابت و ابزارهاب یکسان با اطلس‌های مختلف کار کنید.
یکی از اطلس‌هایی که اخیرا اضافه کردیم Duke Mouse Brain Atlas هستش که رزولوشن فوق‌العاده بالایی داره (۱۵ میکرون) ‌و چون با MRI درست شده، ساختار مغز سالم مونده و اطلس دقیقی رو درست کرده. نکته مهم دیگش اینه که ۱۲ تا تمپلیت مختلف داره و نواحی مختلف مغزی رو خیلی جالب میشه توشون دید بسته به تمپلیت. حتی توی بعضیش میشه لایه‌های کرتکس رو دید!

https://brainglobe.info/blog/duke-mouse-brain-atlas-added.html

@bahramani_ch

چند نفر راجع به زیست‌یار ازم پرسیدن، چنتا نکته که فکر کنم مفید باشه:
۱. زیست‌یار فقط نوروساینس نیست و اتفاقا بیشترش موضوعات زیستی دیگست. الان یک لیستی از موضوعات گذاشتن توی کانالشون.
۲. طبق تجربه‌ای که من داشتم از زیست‌یار، بنظرم بدرد کسایی میخوره که یک بکگراند نسبتا خوبی توی اون فیلد دارن اما هنوز خیلی وارد ریسرچش نشدن. یعنی در مرحله‌ای هستن که میخوان بخش‌های مختلف اون فیلد رو دقیق‌تر وارد بشن و یاد بگیرن چطور میتونن این کار رو بکنن.
۳. کاری که خودم تو دوره‌های قبل میکردم این بود که اولش با اون شخص یک موضوعی رو انتخاب میکردیم (مثلا decision-making) و بعدش من با توجه به علایق و بکگراندش چنتا مقاله رو انتخاب میکردم و اونم شروع میکرد به ترتیب خوندن و هفته‌ای یک جلسه یک ساعته داشتیم و باهم بررسی میکردیم که تا کجا پیش رفته و چه مشکلاتی داشته یا من چیز جدیدی بهش میگفتم درباره خود اون موضوع علمی یا درباره چطور مقاله خوندن و...
البته این مدل برای همه منتورها نیست و من صرفا کاری که خودم کردم (و دوباره شبیه همین خواهم کرد) رو گفتم و سبکش خیلی بستگی به منتور و منتی هم داره طبیعتا.
۵. درنهایت درصورت موفقیت خروجیش این میشه که اون شخص با یک سابفیلد نوروساینس (یا موضوعات زیستی دیگه) یک مقدار بیشتر آشنا میشه و خوبیش اینه که این آشنایی از طریق خوندن و سروکله زدن با چنتا از بهترین مقالات اون فیلد و جلسه هفتگی با منتور کسب شده. بنابراین اون شخص احتمالا اعتماد به نفس اینو پیدا میکنه که خودش بتونه همونو ادامه بده یا اینکه چطور بررسی یک سابفیلد دیگه رو شروع کنه.

دو تا از دوره‌های قبلی زیست‌یار رو من هم بودم (و این یکی رو هم خواهم بود) و خیلی تجربه خوبی بود. نکته مثبتش این بود که بچه‌ها یک زمان نسبتاً زیادی رو با منتورها میگذروندن بنابراین واقعا میشد مطالب زیادی رو منتقل کرد.

سلام بچه‌ها

دوره جدید (چهارم) زیستیار به‌زودی برگزار می‌شه.

اگر کنجکاوی تا یک پدیده در دنیای علوم زیستی را عمیق تر بفهمی یا با یک زمینه که برایت همیشه جالب بوده عمیق ترآشنا بشوی، این طرح برای توست.

در طی این دوره سه‌ماهه، هر دانشجو زیر نظر یک راهنما (یکی از ما!) به مطالعه در حوزه مورد علاقه خود میپردازد.

درباره ما:
ما جمعی از زیست شناسان ایرانی داخل و خارج از ایران هستیم. هدف ما از برگزاری این دوره این است که به دانشجویان ایرانی که به علوم زیستی علاقه دارند کمک کنیم تا علاقه خود را پرورش بدهند.


وبسایت زیستیار:
https://zistyaar.ir/
فیلم ارائه پایانی دانشجویانی که در دوره های قبلی طرح شرکت کردند:
https://www.aparat.com/zistyaar
فرم ثبت نام به همراه اطلاعات بیشتر در مورد طرح زیستیار:
می‌تونید داخل وب‌سایت یک حساب کاربری بسازید و فرم مربوط به دوره چهارم رو پر کنید.

Unlocking spontaneous cognition in the age of data science: the under-estimated utility of resting state neuroimaging data, given exciting new methods to analyse it.

@theNeurologue 🧠