Из маленькой конспективной истории греческого языка Андриотиса из части про элленистическую эпоху и раздела νεωτερισμοὶ στὴ φωνητική, изменения в фонетике:

1. Древнее различие между долгими и краткими гласными постепенно исчезло; со II в. до н. э. все гласные стали одинаковыми по длительности.

2. Ударение в словах из музыкального стало в основном динамическим со II в. н. э., то есть ударный слог произносится уже не столько с более высокой музыкальной нотой, сколько с большей силою.

3. Густое придыхание, которое гораздо раньше исчезло в ионийских говорах Малой Азии и в эолийских на Лесбосе, перестаёт произноситься и, естественно, писаться в народных текстах. Его возвращение в письменность позже станет делом аттикистских грамматиков. Что касается тонкого придыхания, то оно, как мы уже знаем, всегда было просто орфографическим знаком отрицания, указывающим на отсутствие густого придыхания в начальной гласной, чтобы избежать ошибок вроде τὰ ἐφ᾿ ἔτος, μεθ᾿ αὔριον.

4. Иота подписная тоже перестаёт произноситься и, конечно, писаться в нелитературных текстах. Её возвращение и сохранение до сих пор в греческой письменности — также дело аттикистов и «классического» образования.

5. Все дифтонги, имевшие в качестве второго гласного йоту (то есть αι, ει, οι, υι), монофтонгизируются. Так, αι, которое беотийцы превратили в долгое ε уже в IV в. до н. э. и писали вместо него η (πῆς, χήρε, μέμφομη), становится и в койне долгим ε, а затем кратким. Ει, которое совпало с ι уже в V в. до н. э. в Аргосе и в IV в. в Коринфе (о чём свидетельствует написание λέγις), получает это произношение на всей территории «общего греческого». Οι приобретает произношение французского u, которое сохранится до X в. н. э., когда оно совпадёт с ι. Развитие дифтонга οι шло тем же путём. Произношение дифтонга ου как латинского u осуществилось уже в VI в. до н. э. В дифтонгах αυ, ευ, ηυ υ стало согласным в перед гласной или звонким согласным и ф перед глухим согласным, как произносится и сегодня.

6. Простые гласные сохранили древнее произношение, кроме η, которое тоже совпало с ι, и υ, которое сохранит произношение французского u до X в. н. э. А поскольку такое же произношение получило, как мы видели, и οι, орфографические ошибки между υ и οι очень часты. Однако то, что эти изменения не распространились на всю грекоязычную географическую область, подтверждается сохранением произношения η как ε в современных диалектах Понта и Каппадокии (ἔτον = ἦτον, νύφε = νύφη, κεπίν = κηπίον) и сохранением произношения υ и οι спорадически как ου и του.

Вышеуказанными изменениями в древнем произношении гласных и дифтонгов ограничивается прежнее фонетическое разнообразие и умножаются ι (итацизм).

Кроме изменений, у нас есть и выпадения гласных, из которых важнейшее по последствиям для морфологии существительных — выпадение безударного ο в окончаниях -τος, τον (Ἀντώνι(ο)ς, ἐπιστόλι(ο)ν, ποτήρι(ο)ν, παιδί(ο)ν). В койне появляются и первые примеры исчезновения начального гласного (κοιμήθη, μολογώ, σφαλίζω, σχάρα) и превращения α в ε рядом с плавными согласными (ἠλεκάτη, κρεββατίζω и т. п.).

...

В эллинистические времена появляются и первые примеры изменений в сочетаниях согласных, как, например, выпадение μ и ν перед густым согласным (μέφομαι, συφέρουσι, τυχάνω, ἀθρώπου), пропуск конечного ν (τὸ τέκνο σου, εὐχαριστοῦμε), выпадение γ между гласными (ὀλίον, στρατηία, ὑία), что станет частым в новогреческих говорах, превращение λ в ρ рядом с другим согласным (ἀδερφός, ἁρμυρός), диссимиляция двух соседних (ἐκθρός, πάσκω, ἐλέστω) и прочее.»