AlphaFold — история о том, как один успешный эксперимент стал инструментом, который ежедневно меняет биологию.

В 2017-м Джон Джампер пришёл в Google DeepMind, когда там только начинали секретный проект по предсказанию структуры белков. Через три года появилась AlphaFold 2 — алгоритм, который угадывает форму белков с точностью лабораторных методов и за часы, а не месяцы. За это в 2024 году Джампер и Демис Хассабис получили Нобеля.

Спустя пять лет AlphaFold предсказал форму почти 200 млн белков и стал рабочей лошадкой для тысяч лабораторий. Учёные используют его везде: от исследований болезней медоносных пчёл до проектирования новых белков. Появились и «офф-лейбл» применения — например, поиск неизвестных белков по принципу «структурный поиск»: так нашли взаимодействие, определяющее работу сперматозоидов.

Но технологии есть и пределы: AlphaFold хуже справляется с комплексами нескольких белков и динамическими взаимодействиями. Биологи уже научились читать его ограничения: «Он может уверенно сказать ерунду — как ChatGPT», — признаются исследователи.

Тем временем вокруг вырос новый рынок. Recursion, Genesis Molecular AI и университетские группы делают модели, которые идут дальше: предсказывают не только форму белков, но и то, как хорошо потенциальный препарат будет к ним связываться. Точность постепенно сжимают до менее 1 ангстрема — уровня отдельных атомов.

Но Джампер остужает ожидания: предсказать структуру — лишь один шаг в огромной цепочке разработки лекарств. Если бы мир стоял всего в $100 000 от открытия, мы бы уже открыли всё.

Главная интрига — что будет дальше. Джампер мечтает соединить узкую мощь AlphaFold с широкими возможностями LLM. Это напоминает проекты вроде AlphaEvolve, которые комбинируют генерацию идей и автоматическую фильтрацию решений.

Джамперу — 39, он самый молодой нобелевский лауреат по химии за 75 лет. И он не спешит делать «второй АльфаФолд»: «Лучше обращать внимание на маленькие идеи, которые могут перерасти во что-то большее».

Возможно, настоящая революция ещё даже не началась.

@antibiotech