☣️Российские учёные создали первую в мире открытую платформу для сравнения алгоритмов оценки биологического возраста

Платформа ComputAge — плод работы учёных из AIRI и Сколтеха. Она позволяет объективно сравнивать алгоритмы оценки биологического возраста — так называемые «часы старения». Биологический возраст — это показатель здоровья, который может быть выше или ниже паспортного. Если он выше, это сигнализирует о повышенных рисках болезней и сокращении продолжительности жизни. Сегодня его определяют с помощью сложных моделей, которые анализируют эпигенетические и транскриптомные данные, результаты анализов крови и другие биомаркеры.

Под эпигенетическими данными понимаются изменения, которые регулируют работу генов, но не меняют саму последовательность ДНК — например, модификации гистонов или метилирование ДНК. Последнее — это процесс, при котором к молекуле ДНК присоединяется метильная группа, чаще всего к цитозину. Это не меняет код гена, но может «выключать» его, влияя на активность клетки. Транскриптомика, ещё один источник данных для биологических часов, изучает молекулы РНК, которые в данный момент синтезируются клеткой, показывая, какие гены «включены» и насколько активно они работают.

Чтобы создать единую систему оценки, российская команда собрала более 17 000 образцов метилирования ДНК из 104 исследований, охватывающих 19 состояний организма, которые, как предполагается, ускоряют старение. Данные были унифицированы, а затем исследователи протестировали 13 самых популярных моделей «часов старения», созданных ведущими лабораториями США и Европы. Лучшими по точности оказались PhenoAge второго поколения (разработанный в Йельском университете под руководством Морган Левин, ныне работающей в Altos Labs) и GrimAge, созданный в Калифорнийском университете командой Стива Хорвата.

Авторы отмечают, что такие часы могут использоваться для оценки эффективности омолаживающих препаратов — например, метформина или семаглутида — при тестировании на людях, для кластеризации пациентов по рискам, для мониторинга здоровья в клинических исследованиях и даже в носимых устройствах, которые уже начинают показывать пользователям так называемый health index или биологический возраст. Платформа распространяется по лицензии Creative Commons, что позволяет любому исследователю по всему миру использовать её и дорабатывать алгоритмы.

Параллельно с этим в других лабораториях мира появляются новые подходы. Например, исследователи из UCLA предложили оценивать не просто средний уровень метилирования, а так называемую энтропию — степень хаотичности распределения метильных меток по ДНК, что может предсказывать возраст не хуже традиционных моделей. А команда из UC San Diego выдвинула гипотезу, что эпигенетические изменения могут быть не причиной старения, а лишь его отражением, связанным с накоплением соматических мутаций.

Таким образом, новая платформа от AIRI и Сколтеха стала важным шагом к тому, чтобы биологический возраст превратился из модного показателя в реальный инструмент медицины и профилактики заболеваний. Теперь учёные и компании могут объективно выбирать и улучшать алгоритмы, приближаясь к моменту, когда один анализ крови или слюны сможет давать системную оценку здоровья по всем ключевым показателям.

@antibiotech