Post::
by Dmitrii Kriukov

Продолжаем искать теорию старения - теперь в метилировании.

Предсказывать максимальную продолжительность жизни (МПЖ) животных можно не только на основе характеристик генома. В предыдущем посте я упоминал [статью] Стива Хорвата про связь среднего уровня метилирования CpG сайтов и МПЖ. Я наконец разобрался с ней и хочу поведать о том что увидел. Хорват конечно противоречивая фигура. Имея Хирш 151 (scholar), он умудряется соединять в себе: 1) потрясающий организаторский гений, проводя масштабные геномные исследования, объединяя людей в консорциумы для сбора датасетов и создания публикаций; 2) преступную халатность в отношении биоинформатических подходов к анализу данных, порождая антинаучные спекуляции, и манипулируя результатами анализа - начиная со времен эпигенетических часов (часов Хорвата), я бы сказал, его методология это пример того как делать не нужно. Новая статья не стала исключением. Разберемся подробнее.

Датасет.
Он прекрасен, но это не заслуга этой статьи, это заслуга [Mammalyan Methylation Consortium] - множества ученых объединенных идеей оцифровки эпигенетики млекопитающих. 15 тысяч образцов, 36 тысяч консервативных сайтов метилирования, 348 млекопитающих (25 таксономических порядков), 59 типов тканей. Все это хорошо предобработано, и лежит в открытом [доступе]. Качается за 30 минут, при помощи пары команд. Одним словом, прелесть. Преклоняюсь перед организаторским гением, который смог убедить такое количество людей внести вклад в open science.