Article::
Наконец и ваш покорный слуга изошёл на дебютный препринт об исследовании сходства и различий между репрограммированием, интервенциями продлевающими жизнь и старением. Препринт получился увесистый с кучей цветных картинок внутри, но понимая, как сложно бывает читать всё и вся в калейдоскопе aging domain, мы подготовили для вас Fig. 6 - Summary plot - его я дам (см. закреп).
О чём статья?
1) Проанализировали много транскриптомов репрограммирования (bulk), старения и омолаживающих интервенций (типа рапамицина) - посчитали их сигнатуры и сравнили. Получилось ожидаемо, репрограммирование ведет себя омолаживающе.
2) Посмотрели на функциональную интерпретацию этих сигнатур. Получили DNA repair upregulation, но Apoptosis downregulation у репрограммирования - хм, интересно.
3) Зафитили незыблемый ElasticNet на транскриптомы старения (спасибо Саше Тышковскому) и сделали model.predict на репрограммировании. Получилось омоложение (правда не во всех датасетах), довольно консистентное.