Собор Всемилостивого Спаса был построен на пожертвования купеческой вдовы из Воскресенска, Акилины Алексеевны Смирновой (тайной монахини Рафаилы).
Она полностью взяла на себя труды по устроению храма: закупала строительные материалы и церковную утварь, следила за возведением храма.

Закладка собора состоялась 26 мая 1891 года. Главный престол освятили 25 октября 1894 года.
Краснокирпичный пятиглавый храм был внутри украшен четырехъярусным иконостасом, киотами изящной работы и стенными росписями.
Собор неоднократно посещали и служили в нем причисленные к лику святых патриарх Тихон (Беллавин), митрополит Владимир (Богоявленский), митрополит Макарий (Невский), архиепископ можайский Димитрий (Добросердов). Посещала собор великая княгиня Елизавета Фёдоровна Романова.

После закрытия Скорбященского монастыря в 1918 г., собор продолжал действовать как приходской.
В 1922 году во время кампании по изъятию церковных ценностей из него было вывезено 25 пудов золота и серебра.
В 1929 г. собор был закрыт.
Начинается перестройка здания: сносят купола и верх колокольни, внутреннее пространство храма разделяется на 4 этажа.
В соборе стали размещаться различные светские учреждения: Политехникум промысловой кооперации, университет «Станкин», НИИ ИКТИ РАН.
25 декабря 2019 года собор Всемилостивого Спаса вновь передают Русской Православной Церкви, с марта 2021 г. в нем возобновляются богослужения.

С расписанием богослужений можно ознакомиться на сайте всемспас.рф.