Финансирование строительства школ в Киргизии (стоимость проекта 500 миллионов долларов) осуществляется за счёт средств федерального бюджета РФ.

Техническим заказчиком проекта выступает ООО «РенПроектСтрой» (генеральный директор — Авакян Сергей Александрович).

Генеральным подрядчиком указан филиал АО «Мостострой-11», входящий в АО «Группа компаний „Нацпроектстрой"». Фактические работы, например, на площадке в Караколе ведутся АО «ДСК „Автобан"», также входящим в холдинг «Нацпроектстрой».
РенПроектСтрой и Мостострой-11/Автобан не случайно оказались вместе на проекте ЕФСР в Кыргызстане. РенПроектСтрой — давний проектный партнер РЖД. Авакян (владелец РенПроектСтроя) регулярно работает с подрядами РЖД.
 
АО «Мостострой-11» и АО «ДСК „Автобан"» входят в АО «ГК „Нацпроектстрой"» (основные акционеры структуры Аркадия Ротенберга).

Формально компании независимы. Фактически — РенПроектСтрой встроена в подрядную цепочку холдинга НПС, как постоянный субподрядчик-проектировщик. Выбор ЕФСР, в котором РенПроектСтрой стал техзаказчиком, а Мостострой-11 — генподрядчиком, был не случайным, а результатом сложившихся проектных связей внутри этой экосистемы.
ОО «РенПроектСтрой» — микропредприятие с уставным капиталом 50 000 рублей и штатом около 17 человек. При этом выручка компании в 2025 году выросла почти в 6 раз — до 737 млн рублей, что хронологически совпадает с началом работ по проекту ЕФСР в Киргизии. Соразмерность компетенций компании объёму управления строительством школ на 1224 места каждая- вызывает обоснованные сомнения.
 
Раздел закупок на сайте ЕФСР недоступен для публичного ознакомления. Протоколы тендера № 84772814 (завершён 5 ноября 2025 года) не опубликованы. Количество участников, критерии отбора и итоговые суммы контрактов не раскрываются, что исключает общественный контроль за расходованием средств, сформированных  из российского бюджета.