На текущий момент большинство, 53% голосов, за первый ответ. И это верное решение!

Поощрять премиями нужно за проблемную активность. Если отдел разработки постоянно срывает сроки, то хорошая идея премировать за перевыполнение плана. Если в проекте очень много кривого легаси, то можно премировать за его актуализацию.

Но самое главное - нужно заранее известить за что будет выдана премия, чтобы люди сами себе ничего лишнего не придумывали и потом не разочаровывались.