Достаточно интересная статья буржуйского сеошника Оуэйна Ллойд-Уильямса "Технические ловушки SEO, которых следует избегать при миграции интернет-магазинов: доклад BrightonSEO".
Уточню, что здесь идет о миграции не сна другой домен, а на другой e-com движок со сменой структуры URL.