Гуглоид Гэри Ийеш пояснил про особенность индексации страниц, на которые указывают директивы hreflang:

"Здесь действуют два фактора:
1. Альтернативные имена: когда мы канонизируем URL-адрес, другие URL-адреса в кластере дубликатов, из которого он был выбран, могут стать так называемыми альтернативными именами. Они могут использоваться в результатах поиска, если пользовательский запрос заслуживает одного из этих альтернативных имен. Наиболее распространенный пример использования — запросы типа "site:". Если вы выполните поиск, например, [site:bit.ly], мы можем показать множество URL-адресов, которые фактически перенаправляют; они не индексируются в правильном смысле, это просто альтернативные имена канонического URL-адреса.
2. Альтернативные URL-адреса hreflang становятся такими альтернативными URL-адресами: они фактически не индексируются в правильном смысле слова."