Этого приложения нет и не будет в AppCenter, потому что в теории оно может сломать вашу систему. По этой причине установка доступна только из PPA.

elementary Tweaks добавляет некоторые настройки, недоступные через стандартные средства: можно сменить тему оформления и шрифты, изменить расположение кнопок управления окнами, настроить поведение некоторых стандартных приложений и т. д.

Установка:
sudo add-apt-repository ppa:philip.scott/elementary-tweaks
sudo apt update
sudo apt install elementary-tweaks

Если вы до этого не добавляли сторонние репозитории в систему, то сперва введите это:
sudo apt install software-properties-common --no-install-recommends

По завершении установки Tweaks будет доступен в «Параметрах системы».