​​​​После двух месяцев кропотливой работы, AppCenter получает обещанную поддержку Flatpak. Пока только в master-ветке (то есть в девелоперской версии).

Прогнозирую, что официальный релиз мы увидим в elementary OS 6.0.

https://www.reddit.com/r/elementaryos/comments/bs4mzs/appcenter_now_supports_flatpak_in_git_master/