Марк Лутц, «Изучаем Python»: на самом деле мы здесь не модифицировали сам список L1, а изменили компонент объекта, на который L1 ссылается. Изменение такого рода перезаписывает часть значения спискового объекта на месте. Однако поскольку списковый объект совместно используется другой переменной (она ссылается на него), изменение на месте подобного вида оказывает влияние не только на L1. ... В приведенном примере эффект модификации отражается и в списке L2, т.к. он ссылается на тот же самый объект, что и L1. В действительности мы не изменяли список L2, но его значение стало другим, потому что он ссылается на объект, который был перезаписан на месте.