На канале давно не было собственных результатов, но тут надо подождать несколько месяцев - в работе есть очень интересные проекты)

Несколько недель назад в выпуске памяти А.С. Арсеньева вышел наш обзор про ProteinMPNN и близкие методы, с основным упором на возможные применения. В лучших традициях, обзор тут же устарел, потому что одновременно вышел обзор от Бейкера про инженерию в целом и обзор от Martin Pacesa (разработчик BindCraft) про инженерию байндеров, не считая других работ и обзоров.

В нашем обзоре есть иллюстрация, которая возможно ранее не фигурировала в статьях - для аминокислот в каждом положении белка, сравнение разнообразия в природе среди гомологов, и предсказаний ProteinMPNN для одиночных замен. Есть примеры, где и то, и другое совпадает с аминокислотой в конкретном представителе, использовавшемся для предсказания, но есть и все остальные возможные комбинации. Предсказания одиночных мутаций от ProteinMPNN тоже хорошо работают.