Современные анимации движения белковых молекул, без которых сегодня трудно представить научно-популярные ролики о молекулярной биологии, требуют огромных вычислительных мощностей и глубокого понимания молекулярной динамики. Пятьдесят лет назад всё было иначе: громоздкие ЭВМ; программы, вводимые вручную; часы и дни ожидания — ради “оживления” простой молекулярной цепочки.

Молекулярная динамика — область на стыке биологии, физики и математики. Этим материалом мы возрождаем спецпроект об этой важной биофизической отрасли: и если о самом методе и его родоначальниках мы рассказали почти 20 лет назад, то сегодня пришло время отдать дань уважения людям, двигавшим принцип МД в советской науке.

В 1970-е годы, когда на Западе только начинали рассчитывать траектории атомов, в СССР уже моделировали полимеры. Одна из заметных вех — как учёные Гривцов, Балабаев и Шноль провели первое в мире численное моделирование полимера.

На таймлайне — ключевые майлстоуны этой истории:
— Метрополис, Олдер, Рахман;
— Гривцов, Балабаев, Шноль;
— кафедра биофизики МГУ и НИВЦ АН СССР;
— Ферми, Паста, Улам и Цингу.

Эти исследователи первыми научили машины видеть движение молекул. Подробнее — в новой статье спецпроекта “Молекулярная динамика”.