Я часто говорю, что гистидин - неприятная аминокислота для моделирования и инженерии, так как у неё много различных возможных состояний боковой группы, которые еще и рН-чувствительны вблизи типичных значений. Но, в этом можно найти и плюсы - в новом препринте из лаборатории Бейкера гистидины используют для инженерии рН-чувствительных байндеров.
Предлагаются два подхода: 1) ставить гистидины рядом с положительно заряженными остатками, из-за чего при низком рН будет наблюдаться отталкивание; 2) ставить гистидин рядом с двумя акцепторами водородных связей, из-за чего при низком рН взаимодействие будет стабилизироваться.
В статье несколько примеров байндеров с K_D при разных рН, отличающихся до 100 раз.
Ссылка на препринт: https://doi.org/10.1101/2025.09.29.678932
Post #62
694

- ❤ 21
- 🔥 7
- ❤🔥 3