Важный момент, про который иногда забывают при анализе кристаллических структур - что в кристалле у молекулы всегда есть соседи, но для экономии места в структурных файлах обычно хранятся лишь координаты атомов в "асимметричной ячейке" (asymmetric unit cell). Координаты остальных атомов и молекул могут быть получены при помощи операторов симметрии.
Недавно, кристаллизуя белок iRFP, флуоресцирующий в ближнем ИК-диапазоне, наткнулись на любопытный пример: в асимметричной ячейке присутствуют две молекулы белка (зеленая и сиреневая на рисунке), но если посмотреть аккуратно, то становится ясно, что каждая из них является частью димера (соседи по кристаллу показаны желтым). При этом, один из димеров - параллельный, а другой - антипараллельный. Таким образом, в одном кристалле один и тот же белок образовал димеры двух разных типов.
Подробнее - в статье с коллегами из Института цитологии РАН: doi.org/10.1111/febs.70220
Post #47
761

- ❤ 11