Один из самых популярных вопросов про Альфафолд - выучил ли он физику белка, может ли реалистично предсказывать энергию взаимодействий?

В новом препринте сделан аккуратный анализ, общее резюме которого - что-то Альфафолд выучил, но не на 100% и полагаться на него полностью никогда нельзя.

Геометрия белкового остова (бэкбона) предсказывается реалистично, а дальше начинаются чудеса - для взаимодействий отдельных атомов боковых групп могут быть отклонения как в среднем, так и по разбросу, водородные связи иногда предсказываются там, где их нет, а иногда пропускаются там, где должны быть.

https://doi.org/10.1101/2025.06.30.662466