Autoexec.bat в Windows мёртв... для пользователя - да и уже давно. И для системы уже давно, о чём и пишут в блоге. Но! Если он не используется при загрузке (его попросту нет в корневом каталоге), это не значит что он совсем не используется. Комментарий к статье где приводится убедительное доказательство, что несуществующий autoexec.bat Windows всё ещё пытается опросить в момент изменения переменных окружения. К вопросу о тормозах и о дырах, и о об обратной совместимости.