После окончания института Игорь Самарин выбирает на распределении посёлок Адо-Тымово, где работает учителем истории, музыки и даже участвует в школьном учительском хоре. Занимаясь краеведением и распутывая историю братского захоронения в районе села, он увлекается историей русско-японской войны 1904–1905 годов. Все летние каникулы продолжает участвовать в археологических раскопках на юге Сахалина.

После пяти лет учительствования переезжает с семьей в Южно-Сахалинск. Работал учителем в школе № 32, фотографом в Научно-исследовательском институте сельского хозяйства, научным сотрудником археологической лаборатории ЮСГПИ. Первые публикации Самарина в научных сборниках посвящены археологическим разведкам.

Интерес исследователя к русско-японской войне побудил директора В. М. Латышева пригласить И. А. Самарина на работу в Сахалинский областной краеведческий музей научным сотрудником. Его статьи по истории русско-японской войны «Боевые действия на Северном Сахалине во время русско-японской войны 1904–1905 гг.», «Боевые действия подводной лодки «Кета» в Татарском проливе летом 1905 года» были отмечены научной и музейной общественностью.