Фильтры в поиске по спектру. 
#spectrum_search

Итак, поговорим про фильтры в поиске по спектру. Напомню ключевой принцип поиска данных в odanchem: сначала выполняется некоторый общий запрос, а далее результаты можно уточнять. В прошлом посте был продемонстрирован именно такой путь.

Имеющиеся в поиске по спектру фильтры можно разбить на два типа: структурные и спектральные.

Если у вас есть какие-то данные о том, что входит или может входить в состав реакционной системы, то это можно использовать в структурных фильтрах. Самый мощный вариант — фильтр по фрагменту структуры (substructure filter). Если вы ожидаете конкретный структурный блок в искомом веществе, то можно этот блок нарисовать, и среди результатов останутся только молекулы, содержащие данный фрагмент структуры. Помните о возможности задания атомов водорода в явном виде. Если вы где-то его не прорисовали, то там может быть любой заместитель. А если прорисовали — там заместителя точно не будет. Это полезно при условии понимания, какие исходные молекулы у вас были, и какие фрагменты молекулы точно не будут реагировать. 

Второй структурный фильтр — по молекулярной массе. Тут можно использовать результаты, например, ГХ-МС или ВЭЖХ-МС. Если по масс-спектру вы видите, что молекулярная масса вашего вещества, условно, 156 Да, то можно задать фильтр по массе от 155.5 до 156.5. Если у вас есть HRMS, то можно еще сузить диапазон. Система фильтрует по моноизотопной массе, так как заточена именно под комбинацию ЯМР + МС. 

Спектральный фильтр — это, в первую очередь, фиксация обязательных пиков (Mandatory peaks filter). Если вы видите, что какой-то из сигналов особенно интенсивен, или вы понимаете, что именно он вам нужен, можно его зафиксировать. Тогда у вас в результатах выдачи останутся только те спектры, которые содержат данный сигнал. Может быть полезно для последовательного разбора состава смеси. 
Наконец, важная опция — установить допустимое число потерянных сигналов (can be missed). Как обсуждалось в предыдущих постах, наш поиск чувствителен к тому, чтобы все пики были хорошо видны. Если какой-то пик не прокопился, то соответствующая ему молекула не найдется. Добавление возможности потери одного пика решает данную проблему. Но важно учитывать, что при этом количество результатов возрастет на порядок.

В заключение к данному посту напомню: чем шире шкала, тем лучше идет поиск по пикам (пост с описанием причины). Поэтому, с высокой вероятностью, при поиске по ¹³С ЯМР фильтры вообще не понадобятся. А вот при поиске по протонному спектру использование фильтров, по сути, обязательно.
Кроме того напомню, что некоторые поиски у нас могут занимать несколько минут. Это нормально. Можно вкладку с таким поиском закрыть, а потом вернуться к ней из истории поиска.