اوپن‌سورس‌ شدن جهان پروتئین‌ها توسط دیپ‌مایند

پروتئین‌ها واحد‌های پایه اعمال بایولوژیکی بدن انسان هستند. حمل اکسیژن‌ها توسط گلبول‌ها، تشخیص نور توسط چشم‌، حرکت ماهیچه‌ها و تشخیص سلول‌های سرطانی و خلاصه هر چه مکانیزم بایولوژیکی در هر چه موجود زنده هست رو پروتئین‌ها پی‌ریزی می‌کنند. هر پروتئین خودش از رشته‌ای از آمینواسید‌ها تشکیل شده (کلا ۲۰ نوع آمینواسید داریم) که طول این رشته میتونه تا چند هزار آمینواسید هم برسه. حالا نحوه تعامل و فعل و انفعالات بین این آمینواسید‌ها شکل سه‌بعدی یک پروتئین رو تعیین میکنه که بسیار پیچیده و دارای پیچ‌خوردگی‌ها و تا‌های زیادیه. از طرفی همین شکل سه‌بعدی پروتئین تعیین می‌کنه که پروتئین چه کاری و به چه صورتی انجام میده. ما اگر بدونیم میتونیم مثلا سریع‌تر علت بیماری‌ها رو بفهمیم و سریع‌تر براشون دارو و درمان پیدا کنیم یا حتی انزیم‌هایی رو کشف کنیم که بتونن پلاستیک رو بازیافت کنند.
برای چند دهه دانشمندان این حوزه تلاششون بر فهمیدن ساختار یک پروتئین از آمینواسید‌هاش بود که این تلاش‌ها به روش‌های آماری و بعد هم با ظهور ماشین لرنینگ به دیپ‌لرنینگ سپرده شدند. شرکت دیپ‌مایند در چند سال گذشته ابتدا مدل alphafold رو خلق کرد که میتونست همین تسک رو یعنی پیش‌بینی شکل سه‌بعدی هر پروتئین رو انجام بده. مدل alphafold یک مدل انقلابی در حوزه بیوانفورماتیک حساب میشه که یک مساله واقعی رو حل کرده. حالا دیپ‌مایند اومده و طی یک حرکت خفن پیش‌بینی مدل alphafold از شکل سه‌بعدی ۲۰۰ میلیون پروتئين (کل تعداد پروتئین‌هایی که در جهان تا حالا می‌شناسیم) رو اوپن‌سورس کرده! به امید این که سرعت در حوزه تحقیقات بایولوژی بالا بره.

لینک توضیح دیپ‌مایند:
https://www.deepmind.com/blog/alphafold-reveals-the-structure-of-the-protein-universe
لینک دیتابیس اوپن‌سورس شده:
https://alphafold.ebi.ac.uk/

پ.ن.: از این که پست‌های کانال رو به اشتراک می‌گذارید صمیمانه ازتون ممنونیم.

#read
#news

@nlp_stuff