یکی از آنالیزهای مهم و بسیار پرکاربرد توی مطالعات Omicsای، LASSO Regression هست. LASSO یک رویکرد ماشین لرنینگی هست که هم اجازه Feature Selection و هم Regularization رو میده.
توی بسیاری از مقالات یکی دو سال اخیر مرتبط با امیکس و سیستمز بیولوژی، توی بخشی از کار، با استفاده از LASSO و قابلیت Feature Selection اون، اومدن و ژنهای شاخص رو شناسایی کردن. مثل زمانی که با بازسازی و آنالیز شبکه به ژنهای هاب میرسیم، خیلیها از LASSO برای این منظور استفاده کردن (به صورت تجربی دیدم که اکثرا از این متد توی مطالعاتی که هدفشون شناسایی ژنهای تشخیصی بوده، استفاده کردن)
کتابخانههای اختصاصی توی R و پایتون وجود دارن که اجازه استفاده از این متد رو میدن. در کل روش جالبیه و توی چندتا از پروژههای اخیر خودم هم ازش استفاده کردم.
Post #274
792
- 🙏 12
- ❤ 5
- 👍 3