🎓Приглашаем на открытую онлайн-лекцию!

Приглашаем всех заинтересованных присоединиться к очередной лекции в рамках магистерской программы Томского НИМЦ “Биоинформатика. Мультиомика единичных клеток”.

🧬 Тема: Eye1k: многомерный атлас единичных клеток сетчатки и зрительного нерва мыши
🧑‍🔬Лектор: Эмиль Крюков,
Senior Bioinformatician,
Schepens Eye Research Institute of Mass Eye and Ear
Department of Ophthalmology, Harvard Medical School
Department of Ophthalmology, University of Pittsburgh
📅 Дата: 16 июня
🕒 Время: 9:00 Мск
💻 Платформа: Zoom

На лекции будет рассмотрен проект, финальной целью которого является создание комплексного мышиного атласа сетчатки и зрительного нерва. Мы рассмотрим как получить данные из разных источников, унифицировать метаданные, провести индивидуальный процессинг каждого набора данных, контроль качества, фильтрацию клеток и генов, а также привести данные к сопоставимому формату. Также рассмотрим современные методы машинного обучения, включая scvi-tools, scVI и scANVI, и как качество интеграции оценивается с помощью scIB. Отдельное внимание уделим масштабированию анализа, принципам аннотации и обсуждению того, как комплексный атлас помогает сравнивать заболевания, реконструировать временные линии повреждения и старения, находить редкие популяции и определять пробелы в существующих данных.

🔗 Регистрация по ссылке
🎓 Подробнее о магистратуре