У компаний, особенно небольших, практикующих Agile, очень часто присутствуют проблема с документированием продукта и процессов.

Это распространенная болячка, и в интернете очень много разных How-To о том, как это решать.
Хуже, когда люди ссылаются на Agile Manifesto, дескать, работающий софт важнее документации.

Позволю себе процитировать Манифест: “Working software over comprehensive documentation”

Все, в целом, верно. Вот только речь идет о проектной документации, а не продуктовой или технической.