⚡️ФНС предъявила претензии более чем 50 ИТ-компаниям по налоговым льготам «Сколково»

Налоговая служба направила уведомления организациям, которые в одном календарном году теряли право на нулевую ставку налога на прибыль как участники «Сколково» и пытались в том же периоде перейти на нулевую ставку, предусмотренную для аккредитованных ИТ-компаний.
Напомню, что мораторий на проверки ИТ - компаний с 2025 отменен.

Ключевой документ, закрепивший позицию ведомства, письмо ФНС от 20 октября 2025 г. N СД-4-3/9400@. В нём прямо указано: если организация утратила право на льготу «Сколково» в течение года (например, из-за превышения совокупного размера прибыли в 300 млн рублей), она не вправе с первого дня этого же налогового периода применять нулевую ставку по ИТ-основанию. Последовательная смена одной меры господдержки на другую внутри одного периода расценивается как дублирование и суммирование льгот.

Претензии охватили 2023, 2024 и 2025 годы. Если позиция налоговых органов будет признана обоснованной, компаниям грозит перерасчёт налога на прибыль по полной ставке за весь спорный период, а также пени и штрафы за неполную уплату. Итоговые суммы доначислений могут оказаться значительными.

К урегулированию вопроса подключилось Минцифры: ведомство участвует в обсуждении правовой коллизии и пытается выработать единую трактовку норм. Не исключено, что значительная часть споров перейдёт в арбитражные суды.

Ждём дополнительных разъяснений от ведомства.

Ваш ИТ-юрист Светлана Быкова

ВК // Макс