При покупке двух шоколадок, третью дают в подарок.

Правильно
При покупке двух шоколадок третью дают в подарок.

Почему
Потому что для постановки запятой в подобных конструкциях нет никаких оснований. Эта частая ошибка продиктована, вероятно, тем, что при прочтении возникает ощущение паузы. Если хочется её обозначить и на письме, можно немного перестроить предложение и поставить интонационное тире: При покупке двух шоколадок — третья в подарок.