⌛تقسیم بندی نیچ و تنوع درون گونه ای Thaumarchaeota در رسوبات اعماق اقیانوس


💎رسوبات اعماق دریا حاوی تعداد زیادی Thaumarchaeota (شاخه ایی از آرکی ها) هستند که از نظر فیلوژنتیکی(تبارزایی) از همتایان پلاژیک (میان دریا) خود متمایز هستند. تجزیه و تحلیل متاژنومیک (مطالعه مواد ژنتیکی مستقیماً به‌دست آمده از نمونه‌های محیطی ) بر روی نمونه‌هایی از اعماق مختلف یک هسته رسوبی 750 سانتی‌متری جمع‌آوری‌شده از ماریانا انجام شد.

💎فراوانی Thaumarchaeota و archaeal amoA به طور کلی با عمق کاهش می یابد، به جز یک اوج غیرمنتظره در میانه راه. ژنوم‌های مونتاژ شده با متاژنوم تاومارکئوتال به خوشه‌های فیلوژنتیکی متنوع مرتبط با amoA-NP-γ، amoA-NP-θ، و amoA-NP-δ Thaumarchaeota اکسیدکننده آمونیاک و دودمان‌های غیر اکسیدکننده آمونیاک طبقه‌بندی شدند.

💎فراوان ترین گروه در amoA-NP-γ بود، که معمولا در زیستگاه های ساحلی و کم عمق یافت می شود، که نشان دهنده گسترش نیچ بالقوه از محیط های کم عمق دریایی به محیط های hadal (فراژرف) است.

💎این گروه اعماق دریا تغییرات ژنومی درون گونه‌ای را در مقایسه با گروه hadal  فرا ژرف که قبلاً شناسایی شده بود نشان داد، که نشان‌دهنده تنوع ریز هادال Thaumarchaeota همراه با جداسازی نیچ بین محیط‌های اعماق دریا و پلاژیک (عمق متوسط) است. سازگاری های تکاملی مرتبط با گذار از اعماق دریا به پلاژیک (فراژرف) شامل کاهش اندازه ژنوم، از دست دادن حرکت/چسبندگی سلولی، تغییر متابولیسم انرژی، و مکانیسم های مختلف برای جذب و تنظیم بستر (به عنوان مثال، آمونیوم) بود. این یافته‌ها بینش‌های جدیدی را در مورد تکامل hadal Thaumarchaeota ارائه می‌دهد و برای اولین بار، تنوع ژنومی درون گونه‌ای در Thaumarchaeota مربوط به تقسیم‌بندی نیچ اعماق دریا در مقابل پلاژیک (میان دریا) را نشان می‌دهد.

🟢منبع
#معرفی_مقالات
#میکروبیولوژی_دریا
#میکروبیولوژی_محیطی
✈️@IDS_Bio
✈️@IDSchools