Коллектив Лаборатории ИИ в биоинформатике и медицине Института ИИ МГУ представил результаты нового исследования генетической регуляции N‑гликозилирования белков плазмы крови человека. Работа опубликована в ведущем профильном журнале Glycobiology издательства Oxford University Press – ключевом издании в области гликобиологии.
N-гликаны — это сложные углеводные структуры, которые присоединяются к белкам и влияют на их стабильность, активность и взаимодействие с другими молекулами. Биохимические пути и ферменты биосинтеза N‑гликанов хорошо известны. Однако генетическая регуляция этого процесса остается во многом неясной, что ограничивает понимание биологических механизмов, связывающих изменения гликозилирования с развитием заболеваний.
В новой работе исследователи провели полногеномный анализ и определили роль десяти участков генома в регуляции гликозилирования. Связь этих локусов с N-гликозилированием была впервые выявлена в предыдущем исследовании коллектива, однако независимо подтвердить эти ассоциации удалось только сейчас. В результате число локусов с подтвержденной ассоциацией с N-гликозилированием белков плазмы увеличилось с 40 до 50. Дополнительный анализ позволил определить наиболее вероятные гены-кандидаты, лежащие в основе обнаруженных генетических ассоциаций.
«Наша работа не только расширяет список генетических регуляторов гликозилирования, но и предоставляет конкретные гены-кандидаты для функциональных экспериментов. Особый интерес представляют гены FCGR2B и C3, связывающие иммунный и воспалительный сигнальные пути с уровнями гликанов белков плазмы крови человека. Использование двух комплементарных аналитических платформ для измерения N-гликанов позволило нам добиться высокой достоверности результатов и выявить новые биологические механизмы»
— отметила научный сотрудник Института ИИ МГУ Анна Тимощук.
Результаты исследования могут быть применены для разработки новых биомаркеров при заболеваниях, ассоциированных с нарушением гликозилирования.
Ознакомиться подробнее: https://doi.org/10.1093/glycob/cwag029.