DeepZ

Репозиторий содержит код и данные для обучения нейросетей для поиска и выявления паттернов в Z-ДНК генома человека и мышей. Вопрос о роли Z-ДНК в процессе транскрипции актуален для вычислительной биологии и медицины. Исследования роли Z-флипонов в процессе создания РНК-копий генов может помочь в разработке новых лекарств. При обучении учитывалась не только информация из линейной последовательности ДНК, но и данные из десятков тысяч омиксных экспериментов. Обученные модели - для человека и мыши - выявляют в последовательности ДНК участки, которые с наибольшей вероятностью являются Z-ДНК. Работа может быть полезна медикам, биологам, биоинженерам и фармакологам.

статья | код