🧬 بورسیه فول فاند مقطع دکتری (PhD) در زیست‌شناسی مولکولی و زیست‌شناسی RNA در انگلستان 🇬🇧

🎓 فرصت پژوهشی بین‌المللی در دانشگاه لیدز (University of Leeds)
💰 حقوق ماهانه حدود ۵٬۶۰۲ یورو پیش از کسر مالیات و سهم بیمه اجتماعی
⏳ مدت قرارداد: ۳۶ ماه
🔬 برنامه دکتری شبکه پژوهشی ORFeus تحت حمایت اتحادیه اروپا و طرح MSCA

⸻

🧪 معرفی موقعیت پژوهشی

دانشگاه لیدز انگلستان برای یک موقعیت دکتری پژوهش‌محور در چارچوب شبکه دکتری ORFeus، از متقاضیان واجد شرایط بین‌المللی دعوت به همکاری می‌کند. این پروژه بر بررسی سازوکارهای ترجمه RNAهای بلند غیرکدکننده (lncRNAs) و شناسایی پروتئین‌های کوچک یا میکروپروتئین‌هایی تمرکز دارد که ممکن است در فهرست‌های مرجع متداول شناسایی نشده باشند.

هدف اصلی پروژه، بررسی نحوه آغاز و تنظیم فرایند ترجمه در این RNAها و شناسایی ویژگی‌های مولکولی مؤثر بر کارایی ترجمه، به‌ویژه در جریان تمایز سلول‌های انسانی به نورون است.

این پژوهش با استفاده از روش‌های پیشرفته توالی‌یابی و زیست‌شناسی مولکولی، به درک بهتر عملکرد بخش‌هایی از پروتئوم ناشناخته کمک می‌کند و با پروژه‌های مرتبط در زمینه تحلیل تک‌مولکولی، اعتبارسنجی تک‌سلولی، تکامل ویژگی‌های ترجمه و پیش‌بینی مبتنی بر هوش مصنوعی همکاری خواهد داشت.

🔬 محورهای اصلی پژوهش

• بررسی ترجمه RNAهای بلند غیرکدکننده (lncRNA Translation)
• شناسایی میکروپروتئین‌ها و پروتئوم ناشناخته (Dark Proteome)
• بررسی پویایی ریبوزوم‌ها در تمایز سلول‌های عصبی
• شناسایی موتیف‌ها و عوامل تنظیم‌کننده ترجمه
• تحلیل داده‌های توالی‌یابی و پیش‌بینی ویژگی‌های ترجمه

⸻

🧫 وظایف و مسئولیت‌های پژوهشگر دکتری

🔹 اجرای روش TCP-Seq در سلول‌های عصبی انسانی SH-SY5Y برای بررسی حرکت ریبوزوم‌ها و پویایی زیرواحدهای ریبوزومی 40S و 80S در فرایند تمایز سلولی.

🔹 استفاده از توالی‌یابی مستقیم RNA با فناوری خوانش بلند (Long-read Direct RNA Sequencing) برای شناسایی ویژگی‌های ساختاری رونوشت‌ها و عوامل مؤثر بر جذب ریبوزوم.

🔹 بررسی عملکرد عوامل تنظیمی و موتیف‌های مولکولی با استفاده از تحلیل جهش، گزارشگرهای ژنی کوچک (Mini-gene Reporters) و خاموش‌سازی ژن با siRNA.

🔹 اعتبارسنجی عوامل و موتیف‌های تنظیمی منتخب و تهیه نقشه‌ای جامع از الگوهای حرکت ریبوزوم در lncRNAها.

🔹 همکاری با سایر اعضای شبکه ORFeus، مشارکت در توسعه مدل‌های پیش‌بینی و به‌اشتراک‌گذاری داده‌های اعتبارسنجی‌شده از طریق پلتفرم ORFeome.

🔹 تحلیل داده‌ها، مشارکت در فعالیت‌های علمی شبکه و تهیه گزارش پژوهشی پروژه.

🧬 روش‌ها و فناوری‌های مورد استفاده

• Translation Complex Profile Sequencing (TCP-Seq)
• Ribosome Profiling
• کشت سلولی انسانی SH-SY5Y
• توالی‌یابی مستقیم RNA با فناوری Nanopore
• Mini-gene Reporter Assays
• siRNA Knockdown
• تحلیل داده‌های زیستی و همکاری در پلتفرم ORFeome

⸻

🌍 فرصت پژوهشی بین‌المللی در آکسفورد

پژوهشگر منتخب حدود سه ماه را در شرکت Oxford Nanopore Technologies در شهر آکسفورد انگلستان سپری خواهد کرد تا در توسعه فناوری‌های نوین مبتنی بر توالی‌یابی مستقیم RNA برای بررسی ترجمه مشارکت داشته باشد.

همچنین، امکان بهره‌مندی از راهنمایی یک مشاور دانشگاهی مستقل و انجام یک تبادل پژوهشی کوتاه، عمدتاً به‌صورت مجازی، وجود دارد.

⸻

🎯 شرایط و معیارهای واجد شرایط بودن

۱. شرایط عمومی برنامه MSCA

متقاضیان باید در زمان استخدام تمام شرایط زیر را داشته باشند:

🔹 نداشتن مدرک دکتری: متقاضی نباید پیش‌تر مدرک دکتری دریافت کرده باشد. افرادی که از رساله دکتری خود دفاع کرده‌اند اما مدرکشان هنوز رسماً صادر نشده است نیز واجد شرایط نیستند.

🔹 قانون جابه‌جایی (Mobility Rule): متقاضی نباید طی ۳۶ ماه بلافاصله پیش از تاریخ استخدام، بیش از ۱۲ ماه در انگلستان زندگی کرده یا فعالیت اصلی خود، مانند کار یا تحصیل، را در این کشور انجام داده باشد. خدمت اجباری نظامی، اقامت‌های کوتاه مانند تعطیلات و مدت سپری‌شده در فرایند درخواست وضعیت پناهندگی تحت کنوانسیون ژنو، در محاسبه این محدودیت لحاظ نمی‌شوند.

🔹 مدرک تحصیلی: داشتن یا دریافت مدرکی پیش از شروع پروژه که به‌طور رسمی امکان ورود به دوره دکتری را فراهم کند و واجد شرایط بودن برای ثبت‌نام در دوره دکتری دانشگاه لیدز.

🔹 ملیت: متقاضیان از تمام ملیت‌ها امکان درخواست دارند.

🔹 سابقه پژوهشی: محدودیتی برای میزان سابقه پژوهشی قبلی اعلام نشده است؛ مشروط بر آنکه متقاضی مدرک دکتری نداشته باشد.

۲. شرایط اختصاصی پروژه

🔹 داشتن مدرک کارشناسی یا کارشناسی ارشد، یا مدرک معادل، در یکی از رشته‌های زیر یا زمینه‌های مرتبط:

• زیست‌شناسی مولکولی (Molecular Biology)
• بیوشیمی (Biochemistry)
• زیست‌شناسی RNA
• ژنتیک (Genetics)