Со своим обширным опытом битвы с наговнокоденными на коленке приложениями (уже почти 7 лет этим занимаюсь), могу сказать, что есть только одна более-менее эффективная стратегия переписывания говнокода:

1. Обмазываешь больное место тестами
2. Переписываешь
3. Проходишь тесты

Никаких рефакторингов "пока делаю задачу". Никаких рефакторингов без тестов. Никогда.

Отрефаченый код держим в отдельной ветке и сливаем с дев веткой отдельно. Если держать отрефаченый код вместе с кодом какой-то фичи, то удачи вам 🤝🤝.