Вдруг до кого-то новости доходят ещё медленнее, чем до меня. В git наконец-таки завезли inotify. Смотрите в git-config(1) опцию core.fsmonitor. Watchman, необходимый для этой радости в Debian пока нет, пользуюсь из Nix.

Теперь работа с репозиториями размера "дохрена" — Linux, nixpkgs, Gentoo приносит меньше боли и страданий. Ура!