осуждён по статье 58 и приговорён к пяти годам ссылки.

С октября 1939 г. до весны 1944 г. находился в ссылке в посёлке Чимкентской области (точнее — Чулинск, затем Пинск, позднее близ города Чимкент, ныне Шымкент).
В ссылке:
• продолжал писать каббалистические комментарии — на клочках бумаги, на полях книг, иногда даже пищевыми красителями, поскольку письменные материалы были недоступны;
• жена Хана тайно передавала и сохраняла эти записи.

Большая часть этих рукописей позже издана под названием
«Ликутей Леви-Ицхак»
Последние месяцы. Алма-Ата
Весной 1944 года, после окончания срока ссылки, получил разрешение поселиться в Алма-Ате (ныне Алматы).
Там:
• жил в доме местных хасидов;
• тяжело болел после лет заключения;
• продолжал принимать людей, отвечать на галахические вопросы.
Умер 9 августа 1944 года (20 ава 5704). Похоронен на Центральном кладбище Алматы. Его могила стала местом паломничества евреев из разных стран.
Семья
• Жена: Хана Шнеерсон (1880–1964).
• Дети:
• Раби Менахем-Мендел Шнеерсон (1902–1994) — будущий 7-й Любавичский Ребе.
• Двое других сыновей (бар-мицва каждого отмечена в Николаеве и Екатеринославе), умерли в юности до революции.
Наследие
Раби Леви-Ицхак известен как:
1. Последний крупный раввин дореволюционного типа, которому пришлось действовать в условиях жёсткого советского атеизма.
2. Мощный каббалист — его комментарии, написанные в ссылке, стали важной частью хасидской литературы.
3. Отец и духовный наставник Ребе: Менахем-Мендел Шнеерсон неоднократно говорил, что получил от отца фундамент своего учения.