Перечитывая данную часть вопросов становится больше, что имел в виду законодатель?
Возможность подписания документов с использованием усиленной квалифицированной электронной подписи или усиленной неквалифицированной электронной подписи, сертификат ключа проверки которых создан и используется в инфраструктуре, обеспечивающей информационно-технологическое взаимодействие информационных систем, используемых для предоставления государственных и муниципальных услуг и исполнения государственных и муниципальных функций в электронной форме, в установленном Правительством Российской Федерации порядке, предусматривающем в том числе порядок проверки таких электронных подписей, и при условии организации взаимодействия физического лица с указанной инфраструктурой с применением прошедших в установленном порядке процедуру оценки соответствия средств защиты информации, юридическими лицами, индивидуальными предпринимателями, физическими лицами реализуется только с применением многофункционального сервиса обмена информацией, за исключением случаев, если такое подписание необходимо для реализации полномочий государственных органов.
Сертификат ключа проверки которых создан и используется в инфраструктуре - здесь отсылка на постановление 2152, на которое ещё ссылается Консультант, но данное постановление только про НЭП, применительно к КЭП такой инфраструктуры не существует.
Если читать буквально, то всё подписание КЭП и НЭП Госключа со стороны физлиц, юрлиц и ИП должно мигрировать в мессенджер, кроме случаев подписания для реализации полномочий государственных органов, в том числе Москвы.