TGViewer
do...while...ai do...while...ai @doowhile · 1.16K subscribers
Post #279 677
— Чем занимаешься?
— Да, так, ничем, в общем-то. Исправляю ошибки в пайплайне полногеномного секвенсирования и делаю автоматическую интерпретацию.

Наконец-то Dante Labs выложили для скачивания мои VCF, BAM (не прошло и 7 месяцев). Под это дело я решил переделать пайплайн, чтобы он работал не только с генотипированием типа 23andme, но и с WGS. Нашлись ошибки, второй день гоняю ревью через Opus 5, который очень крут в генетике, и исправляю в gpt-5.6 sol, который очень крут в исправлениях ошибок. Fable 5 сразу "включает заднюю", как только видит слово "геном", и незамедлительно превращается в Opus 5, редиска. Но Opus 5 для ревью пайплайн и по теме интерпретации генома — звезда.

Можно было, кстати, пойти простым одноразовым и ненадёжным путём: просто загрузить VCF файл в условный gpt 5.6 Pro и сказать — интерпретируй мне, найди опасные лекарства, посоветуй диету, "накукуй" мне вероятности болезней, расскажи, сколько во мне монгола. А я решил делать (зачем-то) в виде пайплайна многоразового использования. Со всякими нормализациями, фильтрами, подключением кучи справочников типа ClinVar, dbSNP, GWAS, gnomAD, ... а там, некоторые справочники гигов по 80.

Зато — детерминизм, консистентность и идемпотентность кругом. Всё как мы любим :)
  • 😁 11
  • 👍 2
More from @doowhile
  1. Sep 18, 2026AppStore вуайерист Когда я купил себе Apple Dev Certificate, то начал посматривать в топ A…
  2. Sep 17, 2026Новый тип моделей: Jev Тут 15 сентября какие-то ребята с ужасным вкусом (судя по типографи…
  3. Sep 16, 2026"Не зеленое, а круглое" В современных моделях бесит риторический паттерн ответа "не X, а Y…
  4. Sep 16, 2026Переброс сессий между агентами У меня закончились лимиты подписки на Codex (и тыква снова…
  5. Sep 3, 2026Работа на сегодня завершена. Пошёл трогать траву.
  6. Sep 2, 2026Длинные сессии и рекурсия бэклога сессии У меня сейчас есть сессия, которая работает трети…
Threads Profile ViewerView any public Threads profile without an account.Open ThreadLook →Writing with AI? Make it sound human.Metric37 rewrites AI drafts so they read naturally. Free AI detector, 1,500 words free.Try Metric37 →