Но и не буду на всякий случай исключать ещё возможности железа, может быть реально деградировал может процессор. Может оператива, может диск.

Погонял по тестам, попугаев (количество операций на процессоре) немного не такое, которое должно быть, но всё ещё в приемлемом количестве. Возможно ещё и этот фактор сыграл. Может Докер повлиял, может где-то ещё конфиг поднасрал. А может джава неправильная. Впрочем, это уже неважно.