TIL что в bindgen есть возможность прицепить коллбеки, которые будут вызываться для определений, обрабатываемых во время генерации биндингов, и что есть уже готовый CargoCallbacks, который печатает
cargo:rerun-if-changed...
для каждого обрабатываемого файла и каждой явно заданной переменной окружения.